Fondata nel 2002 con la visione coraggiosa di trasformare la scoperta vincitrice del premio Nobel in una nuova classe di farmaci, Alnylam ha lavorato duramente negli ultimi 16 anni per tradurre una possibilità scientifica in realtà con la tecnologia RNA interference. La casa madre si trova negli Stati Uniti e ci sono diverse filiali nel mondo. Fondata nel 2002 come società biofarmaceutica per sviluppo e commercializzazione di nuove terapie basate sull'interferenza dell'RNA, o RNAi, la società si è concentrata su sviluppo e commercializzazione della terapeutica RNAi, stabilendo e mantenendo una forte posizione di proprietà intellettuale in tale campo, stabilendo alleanze strategiche con le principali aziende farmaceutiche, generando ricavi attraverso accordi di licenza, e infine sviluppando e commercializzando la terapia RNAi a livello globale.
Le azioni di Alnylam sono quotate e pubblicate per la negoziazione sul Nasdaq, con simbolo ALNY.
Nel gennaio 2019, la società ha emesso un totale di 5.000.000 di azioni ordinarie attraverso un'offerta pubblica di sottoscrizione ad un prezzo al pubblico di 77,50 dollari per azione. Come risultato dell'offerta, ha raccolto 381,9 milioni di dollari dopo aver dedotto sconti e commissioni di sottoscrizione e altre spese di offerta di circa 5,6 milioni di dollari.
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